In 1988 deed Dijkstra mee aan een openbare idee�nprijsvraag van NRC Handelsblad voor herinrichting van het Museumplein. Aanleiding vormden de uitbreidingsplannen van het Stedelijk Museum. Het Museumplein was op dat moment ingericht met een brede, centrale weg, naar ontwerp van Cornelis van Eesteren en landschapsarchitect Hans Warnau uit 1952-54. In het voorstel van Dijkstra maakte de weg plaats voor ruime voetgangersgebieden tegenover het Concertgebouw en aan de zijde van het Rijksmuseum. De bomenrijen van het plan Warnau bleven in Dijkstra�s voorstel als ruimtelijk bepalend element aanwezig en op het middenterrein kwam een groot grasveld voor manifestaties. Binnen deze opzet gaf hij de geplande uitbreiding van het Stedelijk Museum een duidelijke positie met ertegenover een nieuw bouwblok met publieksvoorzieningen. Dijkstra won de prijsvraag niet, maar hij werd in de jaren daarna wel herhaaldelijk gevraagd om als adviseur op te treden bij verwikkelingen rond het plein.